我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制

2019-10-30 20:48:07 来源: 荆州信息港

人民网北京9月26日电(记者魏艳)记者从科技部得悉,在国家“863”计划、“973”计划和国家自然科学基金、公益性行业科研专项等资助下,中国水产科学研究院联合中国科学院、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作团队完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,并揭露其独特的全基因组复制事件,这是国际上首个完玉成面解析的异源4倍体硬骨鱼类基因组图谱。

鲤鱼是全球散布和养殖范围最广泛的经济鱼类之1,同时是我国最具代表性的淡水养殖鱼类之1,也是我国最有条件利用基因组资源进行品种改进的水产养殖物种之1。鲤鱼基因组由100条染色体组成,是迄今完玉成基因组测序的脊椎动物中染色体数目最多的,其基因组经历了4轮复制,也是迄今为止最为复杂的4倍化脊椎动物基因组之1。

该研究团队完成了雌核发育鲤鱼的精深度测序、精细图谱绘制和基因组注释,其基因组大小约为16.9亿碱基,含有52610个功能基因,约为多数硬骨鱼类基因数目的两倍。通过与斑马鱼基因组进行系统比对,发现鲤鱼和斑马鱼染色体显现典型的2:1同源共线性关系,证实了鲤鱼基因组的4倍化特点及其独特的全基因组复制事件,通过细胞遗传学证据进1步证实了鲤鱼基因组的异源4倍体起源特点。份子钟证据表明鲤鱼基因组4倍化产生在820万年前,是迄今在脊椎动物中发现的最近的基因组倍增事件。同时,展开了全球10个代表性品系(种群)33尾鲤鱼的全基因组重测序研究,共发掘18,949,596个单核苷酸多态性位点和1,694,102个插入/缺失突变位点,首次绘制了全球鲤鱼的单碱基分辨率的基因组遗传变异图谱。另外,通过全基因组多态性扫描和比较转录组分析等手段,辨认和定位了松浦镜鲤鳞被缺失、荷包红鲤鲜红体色等性状相干的遗传位点、功能基因和调控通路。

鲤鱼全基因组序列图谱的完成,标志着鲤科鱼类重要经济性状的遗传解析和遗传选育研究全面进入基因组时期,对解析鲤科鱼类生长、品质、抗病、抗逆等重要经济性状的份子机制具有重要意义,同时为研究脊椎动物基因组进化和基因衍化机制提供了宝贵的数据和模型,为展开全基因组选择育种、培养品质良好的鲤鱼新品种奠定了坚实基础,具有重要的理论意义和利用价值。

该研究成果以Article情势于2014年9月21日在《自然-遗传》(NatureGenetics)杂志在线发表(DOI10.1038/ng.3098)。

[责任编辑]:王莉莎 何文新

[原标题]:《我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制》

[原地址]:http://scitech.people.com.cn/n/2014/0926/c1007⑵5740052.html

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